Met de veelzijdige Joy-Con-controllers kan je op diverse, verrassende nieuwe manieren plezier hebben. Je kunt in iedere hand één Joy-Con-controller houden of ze als één controller gebruiken door ze vast te maken aan de Joy-Con Grip of Joy-Con Charging Grip. De controllers kunnen ook worden vastgemaakt aan het systeem zelf om het in de handheldstijl te gebruiken. Iedere Joy-Con vormt ook een opzichzelfstaande controller, zodat bij bepaalde games voor twee spelers iedere speler één controller kan vasthouden.
